针对您提出的“超容积率依照《城乡规划法》第六十四条的规定进行调查处罚，是否有补充土地出让金的条款”这一问题，目前《城乡规划法》第六十四条未直接规定补充土地出让金的条款，但部分地区会结合土地管理法规要求补缴。若存在地方政府出台的土地管理细则中明确超容积率需补缴土地出让金的情况，土地使用权人需按当地标准补缴；若地方未作相关规定，仅需按《城乡规划法》第六十四条接受罚款、拆除或没收等处罚；若超容积率同时涉及土地用途变更，可能还需结合《土地管理法》的规定补缴土地出让金。针对您提出的“超容积率依照《城乡规划法》第六十四条的规定进行调查处罚，是否有补充土地出让金的条款”这一问题，目前《城乡规划法》第六十四条未直接规定补充土地出让金的条款，但部分地区会结合土地管理法规要求补缴。1.若存在地方政府出台的土地管理细则中明确超容积率需补缴土地出让金的情况：土地使用权人需按照当地规定的计算标准（如按超出部分的土地面积×基准地价或楼面地价）补缴土地出让金，补缴后可能保留超建部分的合法使用权。2.若地方未作超容积率补缴土地出让金的规定：仅需依据《城乡规划法》第六十四条接受罚款（一般按建设工程造价的5%-10%）、限期拆除超建部分或没收超建建筑物等处罚，无需补缴土地出让金。3.若超容积率同时涉及土地用途变更：需结合《土地管理法》第五十六条“建设单位使用国有土地的，应当按照土地使用权出让等有偿使用合同的约定或者土地使用权划拨批准文件的规定使用土地；确需改变该幅土地建设用途的，应当经有关人民政府自然资源主管部门同意，报原批准用地的人民政府批准。其中，在城市规划区内改变土地用途的，在报批前，应当先经有关城市规划行政主管部门同意”的规定，补缴土地用途变更及超容积率对应的土地出让金差额。
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针对您提出的超容积率是否有补充土地出让金条款的问题，《城乡规划法》第六十四条虽未直接提及，但可结合《土地管理法》及地方规定分析其法律依据。《城乡规划法》第六十四条规定：“未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。”该条款未直接规定补缴土地出让金，但《土地管理法》第五十五条明确“以出让等有偿使用方式取得国有土地使用权的建设单位，按照国务院规定的标准和办法，缴纳土地使用权出让金等土地有偿使用费和其他费用后，方可使用土地”，超容积率本质是增加土地利用强度，属于对土地使用权约定条件的变更。部分地方（如《北京市城乡规划条例》）进一步规定，超容积率且尚可改正的，需补缴土地出让金差额，因此在地方有明确规定时，补缴土地出让金具有法律依据，结论为：超容积率补缴土地出让金需以地方配套规定为前提，无地方规定时不强制要求。针对您提出的超容积率是否有补充土地出让金条款的问题，结合实际情况，提供以下实用行动建议：1.查阅地方配套法规：通过当地自然资源局官网或政务服务大厅查询《城乡规划条例》《土地出让金补缴管理办法》等文件，确认本地超容积率是否需补缴土地出让金及具体标准，避免遗漏地方规定。2.向城乡规划部门提交书面咨询：携带土地使用证、建设工程规划许可证等材料，向项目所在地县级以上城乡规划主管部门申请书面答复，明确超容积率的处罚方式是否包含补缴土地出让金，留存答复文件作为后续处理依据。3.委托专业机构核算补缴金额：若需补缴，委托具备资质的土地评估机构根据当地基准地价、超建面积等参数核算应补缴的土地出让金数额，确保金额符合规定，避免因计算错误导致后续纠纷。4.同步办理规划变更手续：若补缴土地出让金后需保留超建部分，需向规划部门申请变更建设工程规划许可证，更新容积率指标，确保超建部分合法化。选择解决方案的重点考虑因素：地方是否有补缴规定、超建部分是否可通过改正措施消除规划影响、补缴成本与保留超建部分的收益对比。若您对地方规定解读或手续办理有疑问，欢迎进一步向律师咨询，获取针对性指导。

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